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PCR實(shí)驗室可開(kāi)展的檢驗項目介紹

發(fā)布時(shí)間:2022-10-13 10:38:51 文章作者:geermo

PCR實(shí)驗室又叫基因擴增實(shí)驗室,PCR是聚合酶鏈式反應(Polymerase Chain Reaction)的簡(jiǎn)稱(chēng)。是一種分子生物學(xué)技術(shù),用于放大特定的DNA片段,可看作生物體外的特殊DNA復制。通過(guò)DNA基因追蹤系統,能迅速掌握患者體內的病毒含量,其精確度高達納米級別。

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在新冠疫情之前,大多數PCR實(shí)驗室集中在大型三級甲等醫院,因其建設成本高、人員素質(zhì)要求高,實(shí)驗室運營(yíng)成本高,常規檢測樣本量少等特點(diǎn),很多二級醫院并沒(méi)有建設。在政策和疫情發(fā)展的推動(dòng)下,各地二級及以上醫療機構都已經(jīng)建立獨立合規的PCR實(shí)驗室,實(shí)驗室人員經(jīng)過(guò)2年多疫情的“錘煉”,也已經(jīng)初步具備了符合崗位要求的素質(zhì)。

新冠疫情終會(huì )結束,除了新冠核酸檢測,“遍地開(kāi)花”的PCR實(shí)驗室還能做些什么呢?

一、感染性疾病分子檢驗項目

1.乙肝病毒核酸檢測

利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR以定量檢測HBV DNA,從而對HBV感染做出快速早期診斷。用于HBV感染的輔助診斷和乙型肝炎患者藥物治療的療效監控。

2.乙肝病毒基因分型檢測

國內HBV基因型中約60%為C型基因,30%為B型基因。應用PCR結合Taqman技術(shù),檢測B/C型HBV特異性DNA核酸片段??梢越Y合臨床表現和其它實(shí)驗室檢測指標對患者病情進(jìn)行評價(jià)。

3.丙肝病毒核酸檢測

利用實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 檢測技術(shù),通過(guò)熒光信號的變化實(shí)現 HCV RNA 的定量檢測。用于HCV感染的輔助診斷和丙型肝炎患者藥物治療的療效監控。

4.丙肝病毒基因分型

應用PCR結合Taqman技術(shù),對1b型、2a型HCV的特異性RNA核酸片段進(jìn)行檢測??梢詫吮具M(jìn)行HCV的基因分型,結合臨床表現和其它實(shí)驗室檢測指標對患者病情進(jìn)行評價(jià)。

5.結核分枝桿菌DNA定量檢測

應用PCR結合Taqman技術(shù),對TB的特異性DNA核酸片段進(jìn)行熒光檢測,從而對TB感染做出快速早期診斷。用于TB感染的輔助診斷和藥物治療的療效監控。

6.EB病毒DNA定量檢測

應用PCR結合Taqman技術(shù),采用EBV特異性引物探針,對EBV DNA進(jìn)行熒光PCR檢測。用于EBV感染的輔助診斷和其它感染患者藥物治療的療效監控。

7.巨細胞病毒DNA定量檢測

應用PCR結合Taqman技術(shù),對CMV特異性DNA核酸片段進(jìn)行熒光檢測,從而對CMV感染做出快速早期診斷。用于CMV感染的輔助診斷和藥物治療的療效監控。

8.單純皰疹病毒DNA定量檢測

應用PCR結合Taqman技術(shù),采用HSV特異性引物探針,分別對HSV 1型和2型的特異性DNA核酸片段進(jìn)行熒光PCR分型檢測,從而對HSV感染做出快速早期診斷。用于HSV感染的輔助診斷和藥物治療的療效監控。

9.肺炎支/衣原體DNA定量檢測

應用PCR結合Taqman技術(shù),對MP和CP的特異性DNA核酸片段同時(shí)進(jìn)行熒光PCR檢測,從而對MP、CP感染做出快速早期診斷。用于MP、CP感染的輔助診斷和藥物治療的療效監控。

10.淋球菌核酸檢測

淋球菌核酸檢測分為核酸提取和恒溫擴增。適用于定性檢測男性尿道拭子標本、女性宮頸拭子標本中的淋球菌RNA。檢測結果可用于淋球菌感染的輔助診斷,為性病的早期診斷以及性病高危人群的初篩提供分子診斷依據。

11.沙眼衣原體核酸檢測

沙眼衣原體核酸檢測分為核酸提取和恒溫擴增。檢測結果可用于沙眼衣原體感染的輔助診斷,為患者的早期診斷以及性病高危人群的初篩提供分子診斷依據。

12.解脲脲原體核酸檢測

解脲脲原體核酸檢測分為核酸提取和恒溫擴增。適用于定性檢測男性尿道拭子標本、女性宮頸拭子標本中的解脲脲原體RNA。檢測結果可用于解脲脲原體感染的輔助診斷,為性病的早期診斷以及性病高危人群的初篩提供分子診斷依據。

13.人乳頭瘤病毒核酸檢測

采用PCR結合熒光探針的體外擴增和檢測技術(shù),對不同型別人乳頭瘤病毒基因型進(jìn)行分型檢測??梢钥焖贉蚀_診斷臨床尖銳濕疣體表面脫落細胞,婦女宮頸細胞及宮頸黏液標本中的HPV DNA??勺鳛榕R床可疑尖銳濕疣確診,宮頸癌病因確定,早期確診,治療效果監測的診斷依據。

14.人類(lèi)免疫缺陷病毒核酸定性檢測

采用一步法RT-PCR體系結合熒光探針的體外擴增和檢測技術(shù)。診斷<18個(gè)月齡嬰兒早期感染;診斷急性HIV-1感染。確定艾滋病病毒感染。

15.人類(lèi)免疫缺陷病毒核酸定量檢測

應用RT-PCR技術(shù)結合熒光探針檢測技術(shù)??捎糜跈z測抗病毒藥物治療效果;監測疾病進(jìn)展;診斷急性HIV-1感染;確定HIV-1感染。

16.B族鏈球菌核酸檢測

利用實(shí)時(shí)定量PCR技術(shù)結合Taqman探針檢測標本中的GBS DNA,從而對GBS感染做出快速早期診斷。

GBS為兼性厭氧的革蘭陽(yáng)性鏈球菌,正常婦女帶菌率達30%左右,屬于條件致病菌,孕婦可感染并通過(guò)產(chǎn)道傳播給新生兒,是目前引發(fā)新生兒感染*主要的致病菌之一。

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二、遺傳性疾病分子檢驗項目

1.Y染色體微缺失檢測

本項目常規檢測的適應證包括:男性不育癥患者選擇單精子卵泡漿內注射或體外受精生育子代前、非梗阻性無(wú)精子癥患者、嚴重少精子癥患者、男性不育癥患者手術(shù)前、原因不明的男性不育癥患者用藥前、無(wú)精子癥患者進(jìn)行睪丸活檢前。

推薦檢測的適應證包括:少精子癥患者、精子密度正常但原因不明的男性不育癥患者、男性不育伴隱睪和(或)精索靜脈曲張的患者、不明原因習慣性流產(chǎn)患者。

2.苯丙氨酸羥化酶基因突變檢測

采用PCR擴增和基因測序方法檢測PAH基因突變。對PAH基因突變進(jìn)行分析診斷,通過(guò)對先證者及其家系的研究,確定致病基因的突變或與致病基因連鎖的多態(tài)標記,從而進(jìn)行直接或間接的診斷,確認突變,查出攜帶者??梢栽赑KU癥狀出現前確診患者,及時(shí)采取治療措施。

3.遺傳性耳聾基因檢測

采用探針特異性PCR技術(shù),檢測人外周血中耳聾相關(guān)基因等位點(diǎn)的基因突變,用于臨床非綜合征耳聾(聽(tīng)力損失)人群的病因輔助診斷以及非聽(tīng)力損失人群耳聾基因攜帶者的檢測。

4.遺傳性藥物性耳聾基因檢測

通過(guò)定性檢測人線(xiàn)粒體基因組中與藥物性耳聾相關(guān)的突變,以輔助臨床診斷及高危人群的篩查和用藥指導,也可用于流行病學(xué)的調查及產(chǎn)前篩查、新生兒產(chǎn)篩領(lǐng)域。

5.地中海貧血基因檢測

采用人外周血標本檢測中國人常見(jiàn)的3種缺失型α-地中海貧血、2種突變型α-地中海貧血和11種突變型β-地中海貧血??梢詫Ω甙l(fā)區中攜帶地中海貧血基因人群進(jìn)行輔助診斷,對婚前、孕期或產(chǎn)前夫婦雙方進(jìn)行檢查,以防止重癥地中海貧血患兒的出生,提高人口素質(zhì)。

三、二代測序檢驗項目

1.BRCA基因突變檢測

BRCA是重要的抑癌基因,包括BRCA1和BRCA2。BRCA1/2基因是評估乳腺癌、卵巢癌和其他相關(guān)癌癥發(fā)病風(fēng)險的重要生物標志物,也是影響患者個(gè)體化治療方案選擇的生物標志物。

對相關(guān)腫瘤患者血液和(或)腫瘤組織進(jìn)行BRCA突變檢測將有助于更好地判斷預后、選擇靶向藥物、選擇化療方案、在適當的條件下對家族遺傳史患者親屬的患病風(fēng)險進(jìn)行評估,幫助醫師根據患者的基因狀態(tài)來(lái)選取更精準的治療方案。

2.肺癌個(gè)性化基因檢測

對于希望接受靶向治療或了解耐藥機制的晚期肺癌患者可采用針對性的肺癌NGS檢測,覆蓋多個(gè)肺癌靶向治療相關(guān)基因,對于肺癌的精準和分層診斷、靶向藥物的選擇等都具有重要臨床指導意義。

3.乳腺癌基因突變檢測

對乳腺癌患者血液和(或)腫瘤組織進(jìn)行基因突變檢測將有助于更好地判斷預后、選擇靶向藥物、選擇化療方案、在適當的條件下對家族遺傳史患者親屬的患病風(fēng)險進(jìn)行評估,幫助醫師根據患者的基因狀態(tài)來(lái)選取更精準的治療方案。

4.BRAF-V600E基因突變檢測

B-RAF突變的預測作用已明確,BRAF-V600E基因突變可導致部分KRAS基因野生型患者對EGFR-TK1及內皮生長(cháng)因子受體單克隆抗體藥物治療不敏感,因此檢測腫瘤患者B-RAF基因突變情況可用于指導靶向藥物的使用。

5.實(shí)體腫瘤相關(guān)基因檢測

通過(guò)雜交捕獲法對腫瘤基因序列進(jìn)行富集,然后通過(guò)測序平臺進(jìn)行高通量測序。通過(guò)檢測腫瘤相關(guān)的基因熱點(diǎn)區域信息,分析這些基因的突變特征,根據患者的個(gè)體差異化,結合藥物基因組學(xué)相關(guān)信息,輔助臨床醫生為癌癥患者選擇合適的治療藥物,制定完善的個(gè)體化治療方案。

四、藥物敏感性相關(guān)分子檢驗項目

1.結核分枝桿菌耐藥基因多態(tài)性檢測

利用實(shí)時(shí)定量PCR儀的不對稱(chēng)PCR擴增技術(shù),檢測對利福平和異煙肼耐藥的結核分枝桿菌基因突變。全球范圍內結核分枝桿菌耐藥率不斷上升,對藥物療效及結核病流行產(chǎn)生很大影響,檢測結合分枝桿菌耐藥基因多態(tài)性對結核病的治療有重要意義。

2.萬(wàn)古霉素耐藥基因檢測

采用實(shí)時(shí)PCR技術(shù)對耐萬(wàn)古霉素腸球菌進(jìn)行核酸擴增和靶序列檢測。指導臨床調整抗生素治療方案;快速篩查,以便于早期發(fā)現醫院內感染性病原體感染者和攜帶者,及時(shí)采取相應干預措施,避免醫院感染的傳播和暴發(fā)。

3.耐甲氧西林金黃色葡萄球菌耐藥基因檢測

采用實(shí)時(shí)PCR技術(shù)對MRSA進(jìn)行核酸擴增和靶序列檢測。用于指導臨床調整抗生素治療方案;早期發(fā)現醫院內感染性病原體感染者和攜帶者,及時(shí)采取相應干預措施,避免醫院感染的傳播和暴發(fā)。

需要明確的是,實(shí)驗室項目的開(kāi)展與實(shí)際的臨床需求緊密相關(guān)。未來(lái)大量中基層醫療機構的PCR實(shí)驗室如何利用起來(lái),是實(shí)驗室管理者需要考量的問(wèn)題。

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